Первоначальный ответ (до обновления - см. Ниже)
Я думал, что ваш файл закладок поврежден.
Обратите внимание, что даже если вы запустите Emacs без файла инициализации (например, emacs -Q) он подберет файл закладок, если он хранится в ожидаемом месте.
Вы можете временно переместить файл закладок в другое место для проверки. Затем вы можете отредактировать его (например, изучить), чтобы найти проблему. Вы можете разделить его рекурсивно, закомментировав 1/2, затем 3/4, 7/8 и т. Д., Чтобы найти какие-либо конкретные части, которые являются проблематичными. Удалите или отремонтируйте эти детали.
ОБНОВЛЕНО -
Исходя из вашего описания и комментариев, я предполагаю, что вы используете Bookmark + , и что вы наткнулись на ошибку, когда , используя пустой файл закладок .
Я только что загрузил исправление для ошибки, которая, я думаю, может решить проблему, с которой вы столкнулись. Пожалуйста, скачайте и попробуйте последнюю версию файла bookmark+-bmu.el.
Извините за беспокойство. Если проблема не устранена и вы используете Bookmark +, введите M-x customize-group bookmark-plus - щелкните ссылку Отправить отчет об ошибке в верхней части.