Flask - это микро-фреймворк, который запускается в экземпляре Python, а не в виде набора файлов, которые обслуживаются с веб-сервера, такого как HTML или PHP. Скорее всего, вам понадобится другой хостинг-провайдер, который размещает веб-приложения, такие как Heroku или использует VPS вместо этого.
С другой стороны, большинство провайдеров виртуального хостинга не позволяют устанавливать пользовательские библиотеки, которыенужно скомпилировать.