Чтобы вызвать метод объекта, вам нужна ссылка на этот объект. Самый простой способ - передать ссылку на родителя при создании потомка. Это не имеет ничего общего с tkinter, это фундаментальный аспект программирования.
...
class child(Button):
def __init__(self, master, parent, **kwargs):
self.parent = parent
super().__init__(master,command = self.main,**kwargs)
def main(self):
self.parent.value += 1
new_parent = parent()
new_parent.children.append(child(root, new_parent, text = 'hello'))
...