Буду признателен за любую помощь: в принципе, я могу заставить мою дендрограмму микробиома выглядеть так, как я хочу, за исключением того, что нижние биты, где кластеризация является самой лучшей, выглядят ВЕРТИКАЛЬНО сжатыми, а не горизонтально. Я пытался повесить его, но это не сдвинуло сплющенные кусочки, а только концы листьев. Итак, у меня осталась дендрограмма, где вы не можете точно сказать, что происходит, потому что нижние горизонтальные линии смешиваются вместе :(
Вот мой код:
mydata <- read.table("rarefied_hier_data.txt", header = TRUE)
hc1 <- agnes(mydata, diss = FALSE, metric = "euclidean", method = "flexible", stand = TRUE, par.method = 1)
hc1 <- as.dendrogram(hc1)
x <- mydata$Samples
labels(hc1) <- x[order.dendrogram(hc1)]
plot(hc1)
А вот фотография того, как выглядит дендрограмма 
Спасибо за любую помощь.