Сертификаты сервера (те, которые вы использовали бы для включения HTTPS на веб-сервере) редко включаются для подписи кода. Я не смотрел ни на один ЦС в мире, и, вероятно, являются исключениями, но чем более «законным» является ЦС, тем меньше вероятность, что они выдадут один сертификат для обоих приложений. В конце концов, я не ожидал бы использовать один и тот же сертификат для обоих.
Существует большая вероятность того, что один сертификат подписи кода будет принят большинством платформ. Документация разработчика каждой платформы должна перечислить, какие сертификаты CA встроены как доверенные корни. Кроме того, большинство платформ позволяет пользователю просматривать и изменять список.