Silverlight не разрешает прямой доступ к файловой системе. Однако вы можете использовать изолированное хранилище для чтения и записи файлов на стороне клиента. Здесь - учебник для этого.
Если вам нужен доступ к папке в веб-приложении, где размещается ваше приложение Silverlight, воспользуйтесь вашим сервисом. Если вы используете метод OperationContract или даже используете WebClient для выполнения запроса в стиле AJAX, вы можете получить доступ к файловой системе на на сервере , но помните, что это машина, отличная от вашего клиента Silverilght, за исключением случаев, когда вы разрабатываете (или просматриваете свое приложение на сервере).