Параметры ACME хранятся в $CADDYPATH/acme
, а не в самой конфигурации Caddy.
Идентификатор учетной записи Let's Encrypt можно изменить в следующем файле JSON: $CADDYPATH/acme/acme-v02.api.letsencrypt.org/users/default/default.json
Надеюсь, что это возможно помогите кому-нибудь еще;)