Из официальной поддержки на форумах kibana:
К сожалению, нет способа сортировать агрегацию фильтров. Однако, в зависимости от сложности ваших фильтров, вы можете создать агрегирование терминов и добавить фильтры ко всей визуализации, например. на прилагаемом изображении я фильтрую, чтобы получить только пункт назначения (Dest) из трех интересующих меня аэропортов и отсортировать их в порядке убывания.
