Использование Graccale Softcopy Presentation State с fo-dicom - PullRequest
Новая
       52

Использование Graccale Softcopy Presentation State с fo-dicom

1 голос
/ 09 апреля 2020

Я хотел бы добавить маркировку к изображению DICOM (например, к чертежам или текстовым комментариям), используя IOD состояния презентации Grayscale Softcopy.

Я создал объект изображения DICOM, например: 

Bitmap bitmap = new Bitmap(path);
            bitmap = GetValidImage(bitmap);
            int rows, columns;
            byte[] pixels = GetPixels(bitmap, out rows, out columns);

            MemoryByteBuffer buffer = new MemoryByteBuffer(pixels);
            DicomDataset imageDataset = new DicomDataset();
            FillDataset(imageDataset);
            DicomDataset annotationdataset = new DicomDataset();
            FillAnnotation(imageDataset, annotationdataset);

            imageDataset.Add(DicomTag.PhotometricInterpretation, PhotometricInterpretation.Rgb.Value);
            imageDataset.Add(DicomTag.Rows, (ushort)rows);
            imageDataset.Add(DicomTag.Columns, (ushort)columns);
            imageDataset.Add(DicomTag.BitsAllocated, (ushort)8);

            DicomPixelData pixelData = DicomPixelData.Create(imageDataset, true);
            pixelData.BitsStored = 8;
            pixelData.SamplesPerPixel = 3;
            pixelData.HighBit = 7;
            pixelData.PixelRepresentation = 0;
            pixelData.PlanarConfiguration = 0;
            pixelData.AddFrame(buffer);



            DicomFile dicomfile = new DicomFile(imageDataset);
            if (File.Exists("test.dcm"))
                File.Delete("test.dcm");
            dicomfile.Save("test.dcm");

Затем я создал объект состояния презентации в градациях серого, например: 

private static void FillAnnotation(DicomDataset imageDataset, DicomDataset annotationDataset)
        {
            //type 1 attributes.
            annotationDataset.Add(DicomTag.SOPClassUID, DicomUID.GrayscaleSoftcopyPresentationStateStorage);
            annotationDataset.Add(DicomTag.StudyInstanceUID, _studyInstanceUid);
            annotationDataset.Add(DicomTag.SeriesInstanceUID, _seriesInstanceUID);
            annotationDataset.Add(DicomTag.SOPInstanceUID, GenerateUid());

            //type 2 attributes
            annotationDataset.Add(DicomTag.PatientID, _patientId);
            annotationDataset.Add(DicomTag.PatientName, _patientName);
            annotationDataset.Add(DicomTag.PatientBirthDate, _patientBirthDate);
            annotationDataset.Add(DicomTag.PatientSex, _patientSex);
            annotationDataset.Add(DicomTag.StudyDate, _studyDateTime);
            annotationDataset.Add(DicomTag.StudyTime, _studyDateTime);
            annotationDataset.Add(DicomTag.AccessionNumber, _accessionNumber);
            annotationDataset.Add(DicomTag.ReferringPhysicianName, _referringPhysicianName);
            annotationDataset.Add(DicomTag.StudyID, _studyID);
            annotationDataset.Add(DicomTag.SeriesNumber, _seriesNumber);
            //annotationDataset.Add(DicomTag.ModalitiesInStudy, "CR");
            annotationDataset.Add(DicomTag.Modality, _modality);
            annotationDataset.Add(DicomTag.Manufacturer, _manufacturer);
            annotationDataset.Add(DicomTag.PresentationCreationDate, _presentationCreationDateTime);
            annotationDataset.Add(DicomTag.PresentationCreationTime, _presentationCreationDateTime);

            DicomDataset serie = new DicomDataset();
            serie.Add(DicomTag.SeriesInstanceUID, _seriesInstanceUID);
            serie.Add(DicomTag.ReferencedImageSequence, imageDataset);

            annotationDataset.Add(DicomTag.ReferencedSeriesSequence, serie);


            DicomDataset displayedArea = new DicomDataset();
            displayedArea.Add(DicomTag.DisplayedAreaTopLeftHandCorner, "50\\50");
            displayedArea.Add(DicomTag.DisplayedAreaBottomRightHandCorner, "100\\100");
            displayedArea.Add(DicomTag.PresentationSizeMode, "SCALE TO FIT");

            annotationDataset.Add(DicomTag.DisplayedAreaSelectionSequence, displayedArea);

            annotationDataset.Add(DicomTag.ICCProfile, Byte.Parse("00000001"));

        }

Я не совсем понимаю, как эти два объекта связаны друг с другом?

1 Ответ

3 голосов
/ 09 апреля 2020

Состояние презентации подключается к изображению с помощью ReferencedSeriesSequence . Я вижу, вы заполняете этот атрибут, так что все должно быть в порядке. Теперь вам также необходимо сохранить состояние презентации в виде отдельного файла DICOM, точно так же, как вы сохраняете изображение. Чтобы проверить результат, просто используйте fo-dicom, чтобы открыть файл PS и прочитать из него, например: 

 var file = DicomFile.Open(your_path, readOption: FileReadOption.ReadAll);
 var dicomDataset = file.Dataset;
 var isItem = dicomDataset.Contains(DicomTag.SOPInstanceUID);
....

Вы можете легко проверить dicomDataset выше в отладчике и увидеть, что все атрибуты, которые вы поставили в PS должен быть там.

Я сделал то же самое, но проблема в том, что я не смог найти бесплатный просмотрщик DICOM, который правильно визуализирует и изображение, и состояние презентации. Все еще ищу одного ....

...