Похоже, что некоторые изменения были сделаны на одном пульте, который не перешел на другой. это может быть вызвано многими причинами.
Каждый раз, когда вы перебазируете идентификатор фиксации последних нескольких коммитов, будет меняться, и это приведет к несоответствию репо c с другим пультом.
Самое простое решение было бы принудительно сделать пу sh репо на один из пультов ...