Три варианта:
1) Используйте базовый тег (это повлияет на каждый относительный URI на вашей странице, включая ссылки, изображения, сценарии, таблицы стилей и т. Д.)
<base href="http://yoursite/">
2) Измените все ваши ссылки на полностью определенные URI
<a href="http://yoursite/yourpage.html">
3) Используйте префикс "/", чтобы показать, что путь указан относительно корня в каждом URI.
<a href="/yourpage.html">
Я лично больше всего использовал опцию base-tag, которая вызывает плохую прессу (от людей, которые использовали ее, не понимая ее). Когда дело доходит до mod_rewrite, базовый тег идеален, так как вы, вероятно, хотите, чтобы все ваши пути были относительно корня, включая все ваши изображения, CSS, сценарии и ссылки.