Я использовал .is (": visible") с хорошими результатами:
if ($("#id_of_item_to_check").is(":visible"))
doSomething();
Я не уверен, что вы пытаетесь сделать, но если вы хотите, скажем, установить Цвет фона - синий для видимых элементов div и красный для остальных:
$.each("div", function( key, value ) {
if ($(this).is(":visible"))
$(this).css("background-color","blue");
else
$(this).css("background-color","blue");
});