Хорошо, я не уверен, почему у меня такое поведение, но в случае, если это поможет другим, я просто опубликую то, что я сделал, чтобы решить мою проблему.
Я использовал Electron 5, я обновил до последней версии v7 на проекте, и глобально на моей машине. Кроме того, окно Electron запускается с окном инструментов Chrome dev, закрепленным справа от приложения. Когда я закрыл это, я смог перетащить окно. Я смог отсоединить инструменты разработчика, и это также позволило перетаскивать окно.