Наверное, нет. Но это не дает никаких преимуществ. Я ожидаю, что даже оптимизатор MySQL будет достаточно умен, чтобы использовать индекс первичного ключа в этом случае.
Однако, если он случайно использовал индекс внешнего ключа, вы, вероятно, не заметите разницу в производительности.
Это добавляет очень, очень, очень небольшое количество накладных расходов для второго сравнения. Но это не может быть измеримо.