Я хочу использовать функцию otu()
в моем фрейме данных B. Я уже использовал функцию unique()
и сжал B в таблицу fst, но, тем не менее, она показывает эту ошибку, когда я пытаюсь запустить
otu(B_fst,,k = 3, threshold = 0.97, method = "central",nstart = 20)
Unable to calculate distance matrix for large k and large alphabet size.
If residues are amino acids consider converting to AAbin object for compression
Это не аминокислота и не последовательность ДНК. Как еще сжать мой фрейм данных для запуска otu ()?
Я почти уверен, что проблема не в large k
, потому что она невелика.