Как сжать фрейм данных в R - PullRequest
0 голосов
/ 09 апреля 2020

Я хочу использовать функцию otu() в моем фрейме данных B. Я уже использовал функцию unique() и сжал B в таблицу fst, но, тем не менее, она показывает эту ошибку, когда я пытаюсь запустить

 otu(B_fst,,k = 3, threshold = 0.97, method = "central",nstart = 20)

Unable to calculate distance matrix for large k and large alphabet size.  
If residues are amino acids consider converting to AAbin object for compression 

Это не аминокислота и не последовательность ДНК. Как еще сжать мой фрейм данных для запуска otu ()?
Я почти уверен, что проблема не в large k, потому что она невелика.

Добро пожаловать на сайт PullRequest, где вы можете задавать вопросы и получать ответы от других членов сообщества.
...