Может ли кто-нибудь обобщить, что такое SBML? Что означает аббревиатура и какова ее цель? Я слышал, что это имеет отношение к системной биологии и компьютерной биологии? Для какой вычислительной биологии она используется?
SBML - сокращение от языка разметки системной биологии. Это основанный на XML формат обмена для вычислительных моделей в системной биологии и вычислительной биологии. В его основе лежит описание моделей, основанных на процессах, через реакции и виды. SBML является стандартом де-факто для обмена такими вычислительными моделями и широко используется для кодирования моделей путей kineti c (например, путей метаболизма c или сетей сигнализации) или моделей метаболизма c на основе ограничений (например, анализ баланса потоков). ). SBML состоит из основного языка и пакетов, которые расширяют его возможности дополнительными функциями. Например, существует пакет для составления иерархической модели или анализа баланса потоков. Для получения дополнительной информации см .: