попробуйте это:
<script type="text/javascript"> //<![CDATA[ //Javascript Alert alert("Put your message here"); //]]> </script>
не имеет значения, куда вы положили это. Но если вы хотите, чтобы он отображался первым, поместите его вверху скрипта, а внизу, чтобы он появился последним