Я следовал https://docs.wso2.com/display/AM260/Installing+and+Configuring+the+Databases этому документу для изменения базы данных по умолчанию на mysql в api manager. Как только я закончу со всеми изменениями и запусту сервер, используя файл "wso2server. sh", он отменит все изменения в файле, и конфигурация базы данных h2 по умолчанию заменит новую конфигурацию для MySql.
На основании описания проблемы похоже, что вы используете API Manager 3.0.0. Начиная с версии 3.0.0, у вас есть файл deploy.toml, который находится в расположении хранилища / conf. Ожидается, что пользователи изменят только этот файл, перейдя вперед. Пожалуйста, обратитесь https://apim.docs.wso2.com/en/3.0.0/install-and-setup/setting-up-databases/changing-default-databases/changing-to-mysql/