Простой интерактивный подход будет выглядеть так:
savefig(h, 'somefig.fig`); % Save figure
% Close the figure ...
openfig('somefig.fig'); % Open figure
% Click on the curves you wanted to delete ....
delete(gco); % delete object -> this takes care of the legend too
% Click on the curves you wanted to delete ....
delete(gco);
% so on...
Этот подход здесь также является альтернативой.