Было бы полезно опубликовать больше вашего кода.
Одним из решений будет печать ваших чисел внизу с фиксированной шириной.
a = 5
print(f'{a:05}') # zero padded on left, fixed length of 5
print(f'{a:5}') # space padded on left, fixed length of 5
Это позволит вам изменить отступы оператора print.
Еще одно решение, которое немного более хаки sh, - это использование длины строкового представления числа.
len(str(i))