Вы должны использовать [[]]
для доступа к элементам в списке, например,
l[[1]][1,1,1] <- 2
Пример
array1 <- array(1,c(1,2,3))
array2 <- array(3,c(2,1,3))
array3 <- array(5,c(2,3,1))
l<-list(array1,array2,array3)
> l
[[1]]
, , 1
[,1] [,2]
[1,] 1 1
, , 2
[,1] [,2]
[1,] 1 1
, , 3
[,1] [,2]
[1,] 1 1
[[2]]
, , 1
[,1]
[1,] 3
[2,] 3
, , 2
[,1]
[1,] 3
[2,] 3
, , 3
[,1]
[1,] 3
[2,] 3
[[3]]
, , 1
[,1] [,2] [,3]
[1,] 5 5 5
[2,] 5 5 5
и l[[1]][1,1,1] <- 2
даст вам
> l
[[1]]
, , 1
[,1] [,2]
[1,] 2 1
, , 2
[,1] [,2]
[1,] 1 1
, , 3
[,1] [,2]
[1,] 1 1
[[2]]
, , 1
[,1]
[1,] 3
[2,] 3
, , 2
[,1]
[1,] 3
[2,] 3
, , 3
[,1]
[1,] 3
[2,] 3
[[3]]
, , 1
[,1] [,2] [,3]
[1,] 5 5 5
[2,] 5 5 5