Лучшее, что вы можете сделать, - установить имя сборки на страницах свойств (узел Свойства в обозревателе решений) на любое значение. Компилятор C # автоматически использует имя сборки в качестве имени процесса (имя файла сгенерированного EXE-файла), поэтому это должно сделать эту работу за вас. Обратите внимание, что имя сборки полностью не зависит от имени проекта и корневого пространства имен.
Конечно, вы можете изменить имя файла EXE после его создания (и это оставит имя сборки без изменений ), хотя я не вижу реальной причины для этого.
Примечание. Я предполагаю, что вы имеете в виду Visual Studio, хотя, вероятно, это мало что значит с точки зрения возможного.