Вам не нужно конвертировать. Если его уже нет на устройстве, вы можете скачать и установить компактный фреймворк там.
Windows Mobile 5 и 6 - это просто дополнительная настройка, ориентированная на телефоны с Windows CE 5. Они двоично совместимы, если вы используете одно и то же семейство процессоров.