разбег сюжета в R Studio занял так много времени

Question

В настоящее время я практикую R, но я обнаружил проблему, когда попытался запустить свой точечный график с помощью ggplot2 с набором данных только 700 КБ. Я не знаю, почему это так долго, я имею в виду около 5-10 секунд только для запуска сюжета. мой р c - это i7 7700HQ и 16 Гб оперативной памяти

Answer 1

Это на самом деле зависит от того, какие библиотеки печати вы используете, но если посмотреть на размер, кажется, что вы рисуете около 100000 точек, что для меня 5 секунд не слишком долго. Если вы используете функцию построения графика, вот несколько сравнений, которые могут помочь из этого источника: Функция ускорения графика () для большого набора данных и https://www.r-bloggers.com/accelerating-ggplot2-use-a-canvas-to-speed-up-rendering-plots/.

Я выполнил следующий код на моем ноутбуке, и вот что я получил за 781,3 Кб:

x <- seq(1, 1000, length.out = 100000)

system.time(plot(x))
    user  system elapsed 
    0.28    3.00    3.42 
system.time(plot(x,pch=20))
    user  system elapsed 
    0.45    5.81    6.31 
system.time(plot(x,pch='.'))
    user  system elapsed 
    0.13    0.92    1.09 

Вы можете увидеть, что при использовании pch производительность может существенно улучшиться.

Answer 2

Это довольно нормально, вы не можете ожидать хорошего рендеринга (и разумного времени рендеринга), нанося более 1k или 10k точек на диаграмму рассеяния. Это называется "перплотингом". Что вы можете сделать: заменить geom_point() на geom_hex() или stat_density_2d()

Если вам конкретно нужен точечный график, я предлагаю попробовать растровый . Сначала он будет разумным образом объединяться для создания растров, а затем визуализировать выходные данные.

Особенно, если вы хотите импортировать свои диаграммы в другой документ, вам необходимо ограничить размер и количество отображаемых объектов (важно для векторных изображений).