разводя вершины сети x в k-раздельном графе - PullRequest
Новая
       77

разводя вершины сети x в k-раздельном графе

0 голосов
/ 14 апреля 2020

У меня есть k-раздельный граф, в котором узлы очень близки друг к другу. Если я добавлю метку True, она будет выглядеть очень загроможденной.

1) Как я могу распределить график с достаточными расстояниями между узлами 2) Если метки узлов большие, как увеличить размер узлов, чтобы он соответствовал меткам внутри.

Ниже приведен фрагмент кода 

 G = nx.Graph()

G.add_nodes_from(emc["entity"], bipartite=0)
G.add_nodes_from(set(EMM_unique["keys"]).symmetric_difference(set(emc["entity"])), bipartite=1)
G.add_nodes_from(EMM["id"], bipartite=2)
G.add_edges_from(list(emc.itertuples(index=False)))
G.add_edges_from(list(EMM.itertuples(index=False)))

nodes = G.nodes()
# for each of the parts create a set
nodes_0  = set([n for n in nodes if  G.nodes[n]['bipartite']==0])
nodes_1  = set([n for n in nodes if  G.nodes[n]['bipartite']==1])
nodes_2  = set([n for n in nodes if  G.nodes[n]['bipartite']==2])


 # set the location of the nodes for each set
pos = dict()
pos.update( (n, (i, -1)) for i, n in enumerate(nodes_0) ) # put nodes from X at x=1
pos.update( (n, (i, -2)) for i, n in enumerate(nodes_1) ) # put nodes from Y at x=2
pos.update( (n, (i, -3)) for i, n in enumerate(nodes_2) ) # put nodes from X at x=1


color_map = []
for node in G:
    if node in emc["entity"].values:
       color_map.append("red")
    elif node in EMM["id"].values:
        color_map.append("green")
    else:
        color_map.append("cyan")

nx.draw(G, pos, node_color=color_map, node_size= [len(n)*20 for n in G.nodes()], font_color= "blue",font_size=7, alpha=0.7, node_shape="s", with_labels=True, with_arrows=True)

Я уже пробовал вариант изменения размера_узла по длине узла строки, но, как видно из изображения, он слишком загроможден из-за меньшего расстояния между узлами. Может ли кто-нибудь также помочь мне создать поле метки вне узлов? Эта опция также исправит проблему. Спасибо

PS Я знаю, что такие варианты доступны в двухстороннем формате, но я не использую двудольный.

enter image description here

1 Ответ

1 голос
/ 14 апреля 2020

Поскольку вы фиксируете позиции, проблема на самом деле в том, что не хватает места для чтения меток, и они будут перекрываться. Поэтому, если вы хотите сохранить эти позиции, вы можете сделать следующее: повернуть метки. Для этого вы можете отдельно нарисовать метки с помощью nx.draw_networkx_labels, а затем повернуть их с помощью: 

nx.draw(G, pos, 
        node_color=color_map, 
        font_size=7, 
        with_labels=False,
        alpha=0.7, 
        node_shape="s", 
        with_arrows=True)

label = nx.draw_networkx_labels(G, 
                               pos,
                               font_size=12)

for _,n in label .items():
    n.set_rotation('vertical')
...