Оптимальный способ транспонировать строки в одном кадре данных в столбцы в другом кадре в Pandas? - PullRequest
2 голосов
/ 23 марта 2020

Дано df_people :

   Name
0  Tom
1  Jerry

и df_colors (без строки заголовка):

0  Red
1  Green
2  Blue

Что считается оптимальным способом взять данные в df_colors и добавить их к df_people так, чтобы df_people выглядело бы так при объединении:

   Name   Color_0  Color_1  Color_2
0  Tom    Red      Green    Blue
1  Jerry  Red      Green    Blue

Ниже что у меня пока что работает, но мне было интересно, есть ли лучший или более краткий способ.

# Store data for new columns in a dictionary
new_columns = {}
for index_people, row_people in df_people.iterrows():
    for index_colors, row_colors in df_colors.iterrows():
        key = 'Color_' + str(index_colors)
        if (key in new_columns):
            new_columns[key].append(row_colors[0])
        else:
            new_columns[key] = [row_colors[0]]

# Add dictionary data as new columns
for key, value in new_columns.items():
    df_people[key] = value

ОБНОВЛЕНИЕ

Спасибо всем за предоставление ответы. Поскольку реальные кадры данных имеют размер в ГБ, скорость имела решающее значение, поэтому я выбрал самый быстрый метод. Вот код для тестовых случаев:

# Import required modules
import pandas as pd
import timeit

# Original
def method_1():
    df_people = pd.DataFrame([['Tom'], ['Jerry']], columns=['Name'])
    df_colors = pd.DataFrame([['Red'], ['Green'], ['Blue']], columns=None)
    # Store data for new columns in a dictionary
    new_columns = {}
    for index_people, row_people in df_people.iterrows():
        for index_colors, row_colors in df_colors.iterrows():
            key = 'Color_' + str(index_colors)
            if (key in new_columns):
                new_columns[key].append(row_colors[0])
            else:
                new_columns[key] = [row_colors[0]]
    # Add dictionary data as new columns
    for key, value in new_columns.items():
        df_people[key] = value

# YOBEN_S - https://stackoverflow.com/a/60805881/452587
def method_2():
    df_people = pd.DataFrame([['Tom'], ['Jerry']], columns=['Name'])
    df_colors = pd.DataFrame([['Red'], ['Green'], ['Blue']], columns=None)
    _s = pd.concat([df_colors]*len(df_people), axis=1)
    _s.columns = df_people.index
    df_people = df_people.join(_s.T.add_prefix('Color_'))

# Dani Mesejo - https://stackoverflow.com/a/60805898/452587
def method_3():
    df_people = pd.DataFrame([['Tom'], ['Jerry']], columns=['Name'])
    df_colors = pd.DataFrame([['Red'], ['Green'], ['Blue']], columns=None)
    # Create mock key
    _m1 = df_people.assign(key=1)
    # Set new column names, transpose, and create mock key
    _m2 = df_colors.set_index('Color_' + df_colors.index.astype(str)).T.assign(key=1)
    df_people =  _m1.merge(_m2, on='key').drop('key', axis=1)

# Erfan - https://stackoverflow.com/a/60806018/452587
def method_4():
    df_people = pd.DataFrame([['Tom'], ['Jerry']], columns=['Name'])
    df_colors = pd.DataFrame([['Red'], ['Green'], ['Blue']], columns=None)
    df_colors = df_colors.T.reindex(df_people.index).ffill().add_prefix('Color_')
    df_people = df_people.join(df_colors)

print('Method 1:', timeit.timeit(method_1, number=10000))
print('Method 2:', timeit.timeit(method_2, number=10000))
print('Method 3:', timeit.timeit(method_3, number=10000))
print('Method 4:', timeit.timeit(method_4, number=10000))

Вывод:

Method 1: 36.029883089
Method 2: 27.042384837999997
Method 3: 68.22421793800001
Method 4: 32.94155895

В моих попытках упростить сценарий, к сожалению, я упростил его. Сейчас уже слишком поздно перефразировать вопрос, поэтому я думаю, что опубликую соответствующий вопрос позже. Реальный сценарий также включает математику, поэтому вместо простого добавления столбцов в df_colors к df_people мне также необходимо выполнить некоторые вычисления для столбца в соответствующей строке для каждой добавленной ячейки.

ОБНОВЛЕНИЕ 2

Я увеличил выборку данных (спасибо Jezrael) и добавил два новых метода.

# Import required modules
import numpy as np
import pandas as pd
import timeit

# Original
def method_1():
    df_people = pd.DataFrame(['Tom', 'Jerry', 'Bob', 'John', 'Bill', 'Tim', 'Harry', 'Rick'] * 1000, columns=['Name'])
    df_colors = pd.DataFrame(['Red', 'Green', 'Blue'] * 10, columns=None)
    # Store data for new columns in a dictionary
    new_columns = {}
    for index_people, row_people in df_people.iterrows():
        for index_colors, row_colors in df_colors.iterrows():
            key = 'Color_' + str(index_colors)
            if (key in new_columns):
                new_columns[key].append(row_colors[0])
            else:
                new_columns[key] = [row_colors[0]]
    # Add dictionary data as new columns
    for key, value in new_columns.items():
        df_people[key] = value

# YOBEN_S - https://stackoverflow.com/a/60805881/452587
def method_2():
    df_people = pd.DataFrame(['Tom', 'Jerry', 'Bob', 'John', 'Bill', 'Tim', 'Harry', 'Rick'] * 1000, columns=['Name'])
    df_colors = pd.DataFrame(['Red', 'Green', 'Blue'] * 10, columns=None)
    _s = pd.concat([df_colors]*len(df_people), axis=1)
    _s.columns = df_people.index
    df_people = df_people.join(_s.T.add_prefix('Color_'))

# sammywemmy - https://stackoverflow.com/a/60805964/452587
def method_3():
    df_people = pd.DataFrame(['Tom', 'Jerry', 'Bob', 'John', 'Bill', 'Tim', 'Harry', 'Rick'] * 1000, columns=['Name'])
    df_colors = pd.DataFrame(['Red', 'Green', 'Blue'] * 10, columns=None)
    # Create a new column in df_people with aggregate of df_colors;
    df_people['Colors'] = df_colors[0].str.cat(sep=',')
    # Concatenate df_people['Name'] and df_people['Colors'];
    # split column, expand into a dataframe, and add prefix
    df_people = pd.concat([df_people.Name, df_people.Colors.str.split(',', expand=True).add_prefix('Color_')], axis=1)

# Dani Mesejo - https://stackoverflow.com/a/60805898/452587
def method_4():
    df_people = pd.DataFrame(['Tom', 'Jerry', 'Bob', 'John', 'Bill', 'Tim', 'Harry', 'Rick'] * 1000, columns=['Name'])
    df_colors = pd.DataFrame(['Red', 'Green', 'Blue'] * 10, columns=None)
    # Create mock key
    _m1 = df_people.assign(key=1)
    # Set new column names, transpose, and create mock key
    _m2 = df_colors.set_index('Color_' + df_colors.index.astype(str)).T.assign(key=1)
    df_people =  _m1.merge(_m2, on='key').drop('key', axis=1)

# Erfan - https://stackoverflow.com/a/60806018/452587
def method_5():
    df_people = pd.DataFrame(['Tom', 'Jerry', 'Bob', 'John', 'Bill', 'Tim', 'Harry', 'Rick'] * 1000, columns=['Name'])
    df_colors = pd.DataFrame(['Red', 'Green', 'Blue'] * 10, columns=None)
    df_colors = df_colors.T.reindex(df_people.index).ffill().add_prefix('Color_')
    df_people = df_people.join(df_colors)

# jezrael - https://stackoverflow.com/a/60826723/452587
def method_6():
    df_people = pd.DataFrame(['Tom', 'Jerry', 'Bob', 'John', 'Bill', 'Tim', 'Harry', 'Rick'] * 1000, columns=['Name'])
    df_colors = pd.DataFrame(['Red', 'Green', 'Blue'] * 10, columns=None)
    _a = np.broadcast_to(df_colors[0], (len(df_people), len(df_colors)))
    df_people = df_people.join(pd.DataFrame(_a, index=df_people.index).add_prefix('Color_'))

print('Method 1:', timeit.timeit(method_1, number=3))
print('Method 2:', timeit.timeit(method_2, number=3))
print('Method 3:', timeit.timeit(method_3, number=3))
print('Method 4:', timeit.timeit(method_4, number=3))
print('Method 5:', timeit.timeit(method_5, number=3))
print('Method 6:', timeit.timeit(method_6, number=3))

Вывод:

Method 1: 74.512771493
Method 2: 1.0007798979999905
Method 3: 0.40823360299999933
Method 4: 0.08115736700000298
Method 5: 0.11704620100000795
Method 6: 0.04700596800000767

ОБНОВЛЕНИЕ 3

Я разместил связанный вопрос для транспонирования и вычислений, который более точно отражает реальный набор данных:

Самый быстрый способ транспонирования и вычисления в Pandas?

Ответы [ 6 ]

1 голос
/ 24 марта 2020

Вы можете улучшить производительность с помощью numpy.broadcast_to метода:

df_people = pd.DataFrame([['Tom'], ['Jerry']], columns=['Name'])
df_colors = pd.DataFrame([['Red'], ['Green'], ['Blue']], columns=None)

a = np.broadcast_to(df_colors[0], (len(df_people), len(df_colors)))
df = df_people.join(pd.DataFrame(a, index=df_people.index).add_prefix('Color_'))
print (df)
    Name Color_0 Color_1 Color_2
0    Tom     Red   Green    Blue
1  Jerry     Red   Green    Blue

import timeit

def method_2():
    df_people = pd.DataFrame([['Tom'], ['Jerry']], columns=['Name'])
    df_colors = pd.DataFrame([['Red'], ['Green'], ['Blue']], columns=None)
    _s = pd.concat([df_colors]*len(df_people), axis=1)
    _s.columns = df_people.index
    df_people = df_people.join(_s.T.add_prefix('Color_'))

def method_5():
    df_people = pd.DataFrame([['Tom'], ['Jerry']], columns=['Name'])
    df_colors = pd.DataFrame([['Red'], ['Green'], ['Blue']], columns=None)
    a = np.broadcast_to(df_colors[0], (len(df_people), len(df_colors)))
    df_people = df_people.join(pd.DataFrame(a, index=df_people.index).add_prefix('Color_'))

print('Method 2:', timeit.timeit(method_2, number=10000))
Method 2: 27.919169027998578

print('Method 5:', timeit.timeit(method_5, number=10000))
Method 5: 21.452649746001043

Но я думаю, что лучше тестировать в больших DataFrame, например, здесь для 3k строки и 30 столбцов, то время отличается:

# Import required modules
import pandas as pd
import timeit

# Original
def method_1():
    df_people = pd.DataFrame(['Tom','Jerry','Bob'] * 1000, columns=['Name'])
    df_colors = pd.DataFrame(['Red','Green', 'Blue'] * 10, columns=None)
    # Store data for new columns in a dictionary
    new_columns = {}
    for index_people, row_people in df_people.iterrows():
        for index_colors, row_colors in df_colors.iterrows():
            key = 'Color_' + str(index_colors)
            if (key in new_columns):
                new_columns[key].append(row_colors[0])
            else:
                new_columns[key] = [row_colors[0]]
    # Add dictionary data as new columns
    for key, value in new_columns.items():
        df_people[key] = value

# YOBEN_S - https://stackoverflow.com/a/60805881/452587
def method_2():
    df_people = pd.DataFrame(['Tom','Jerry','Bob'] * 1000, columns=['Name'])
    df_colors = pd.DataFrame(['Red','Green', 'Blue'] * 10, columns=None)
    _s = pd.concat([df_colors]*len(df_people), axis=1)
    _s.columns = df_people.index
    df_people = df_people.join(_s.T.add_prefix('Color_'))

# Dani Mesejo - https://stackoverflow.com/a/60805898/452587
def method_3():
    df_people = pd.DataFrame(['Tom','Jerry','Bob'] * 1000, columns=['Name'])
    df_colors = pd.DataFrame(['Red','Green', 'Blue'] * 10, columns=None)
    # Create mock key
    _m1 = df_people.assign(key=1)
    # Set new column names, transpose, and create mock key
    _m2 = df_colors.set_index('Color_' + df_colors.index.astype(str)).T.assign(key=1)
    df_people =  _m1.merge(_m2, on='key').drop('key', axis=1)

# Erfan - https://stackoverflow.com/a/60806018/452587
def method_4():
    df_people = pd.DataFrame(['Tom','Jerry','Bob'] * 1000, columns=['Name'])
    df_colors = pd.DataFrame(['Red','Green', 'Blue'] * 10, columns=None)
    df_colors = df_colors.T.reindex(df_people.index).ffill().add_prefix('Color_')
    df_people = df_people.join(df_colors)

def method_5():
    df_people = pd.DataFrame(['Tom','Jerry','Bob'] * 1000, columns=['Name'])
    df_colors = pd.DataFrame(['Red','Green', 'Blue'] * 10, columns=None)
    a = np.broadcast_to(df_colors[0], (len(df_people), len(df_colors)))
    df_people = df_people.join(pd.DataFrame(a, index=df_people.index).add_prefix('Color_'))

print('Method 1:', timeit.timeit(method_1, number=3))
print('Method 2:', timeit.timeit(method_2, number=3))
print('Method 3:', timeit.timeit(method_3, number=3))
print('Method 4:', timeit.timeit(method_4, number=3))
print('Method 5:', timeit.timeit(method_5, number=3))

Method 1: 34.91457201199955
Method 2: 0.7901797180002177
Method 3: 0.05690281799979857
Method 4: 0.05774562500118918
Method 5: 0.026483284000278218
1 голос
/ 23 марта 2020

Мы можем сделать

s=pd.concat([df1]*len(df),axis=1)
s.columns=df.index
df=df.join(s.T.add_prefix('color_'))
    Name color_0 color_1 color_2
0    Tom     Red   Green    Blue
1  Jerry     Red   Green    Blue
0 голосов
/ 23 марта 2020

вы можете использовать:

colors = df_colors.T.append(df_colors.T).add_prefix('Color_').reset_index(drop=True)
pd.concat([df_people, colors], axis=1)

выход:

enter image description here

0 голосов
/ 23 марта 2020

Использование DataFrame.reindex, DataFrame.ffill и DataFrame.add_prefix:

df2 = df2.T.reindex(df1.index).ffill().add_prefix('Color_')
df1 = df1.join(df2)

    Name Color_0 Color_1 Color_2
0    Tom     Red   Green    Blue
1  Jerry     Red   Green    Blue
0 голосов
/ 23 марта 2020

Другое возможное решение:

#create a new column in df1, with aggregate of df2:
 #i set the header for df2 column as 'color'
 df1['color'] = df2['color'].str.cat(sep=',')
#concatenate df1['Name'] and df1['Color'] as below:
pd.concat([df1.Name,
            #split column, expand into a dataframe and add prefix
           df1.color.str.split(',',expand=True).add_prefix('color_')],
          axis=1)

    Name    color_0 color_1 color_2
0   Tom       Red   Green   Blue
1   Jerry     Red   Green   Blue
0 голосов
/ 23 марта 2020

Вы можете сделать:

import pandas as pd

# input sample data
df1 = pd.DataFrame([['Tom'], ['Jerry']], columns=['name'])
df2 = pd.DataFrame([['Red'], ['Gree'], ['Blue']], columns=None)

# create mock key
m1 = df1.assign(key=1)

# set new column names, transpose and create mock key
m2 = df2.set_index('Color_' + df2.index.astype(str)).T.assign(key=1)

result = m1.merge(m2, on='key').drop('key', axis=1)

print(result)

Выход

    name Color_0 Color_1 Color_2
0    Tom     Red    Gree    Blue
1  Jerry     Red    Gree    Blue
Добро пожаловать на сайт PullRequest, где вы можете задавать вопросы и получать ответы от других членов сообщества.
...