вы можете попытаться добавить "console": "internalConsole"
при запуске . json, например:
"configurations": [
{
"type": "java",
"name": "CodeLens (Launch) - App",
"request": "launch",
"mainClass": "com.test.maven.App",
"console": "internalConsole",
"projectName": "my.app"
}
]
, тогда оно будет отображаться в Debug Console