Да, вы должны сделать толстый JAR, то есть файл JAR, который содержит все зависимости, которые требуются вашему проекту. Вы можете добавить библиотеки в свой JAR-файл, щелкнув в IntelliJ следующее:
Файл> Структура проекта> Артефакты> щелкните символ «+»> Извлеченный каталог> и затем выберите все файлы .jar в папке JavaFX.
Если вы используете JavaFX 11 или выше, также включите .so файлы:
Файл> Структура проекта> Артефакты> щелкните символ «+»> Файл> и затем выберите все .so файлы в папке JavaFX.