DocFX действительно генерирует содержимое c, однако основной индекс. Страница html попытается загрузить некоторые ресурсы, такие как оглавление (в c. html), используя XMLHttpRequest из браузера. Такие запросы будут заблокированы браузером, если вы загрузили сайт, открыв страницу индекса. html с диска.
Если вы попытаетесь, запустите инструменты разработчика F12 в Chrome (или браузере вашего выбор), и вы увидите предупреждения, такие как:
Доступ к XMLHttpRequest в 'file: ///your-path/_site/toc.html' из источника 'null' имеет был заблокирован политикой CORS: запросы на разные источники поддерживаются только для схем протоколов: http, data, chrome -extension, edge, https.
В результате сайт действительно должен быть загружен с веб-сервера по HTTP, чтобы получить лучший результат