Как сравнить координаты ядер в микроскопических c изображениях из разных каналов? - PullRequest
0 голосов
/ 14 апреля 2020

Я работаю над проектом анализа изображений микроскопа c. Давайте рассмотрим данную клеточную линию. У меня есть изображения в светлых полях и их флуоресцентные изображения из красного и зеленого каналов.

Моя задача - пометить каждую ячейку в изображениях светлого поля, чтобы она была красной, зеленой, оранжевой (красный + зеленый) или ни одной из них. их.

Для этого я сегментировал изображения и сохранял их координаты в кадре данных CSV (я сделал это с Фиджи).

Структура информационного кадра:

"Метка" | "Х" | «Y», то же самое для другого набора данных флуоресценции и набора данных светлого поля, поэтому у меня есть 3 кадра данных.

(где метка хранит имя файла изображений.)

Например:

img-1.jpg X1, Y1 img-1.jpg X2, Y2 img-1.jpg X3, Y3. , img-2.jpg X4, Y4. , et c ..

Так как количество обнаруженных ячеек на изображениях не равно, чтобы они не сохранялись в кадрах данных в одном и том же порядке, как я могу решить, что данная ячейка с данным с Координаты X, Y на изображении яркого поля можно найти на одном из флуоресцентных изображений (или на обоих)

...