Я ищу четкое объяснение того, как правильно интерпретировать эллипсы ординации на графике NMDS и как эта интерпретация изменяется с различными выбранными пользователем уровнями достоверности и типами эллипса (например, стандартная ошибка по сравнению со стандартным отклонением). В частности, я использую функцию ordiellipse() в пакете vegan.
Например, на моем графике NMDS мои данные сгруппированы по коэффициенту с тремя уровнями. Я могу построить три отдельных эллипса ординации, используя ordiellipse(), специфицируя kind='sd' и conf=.60, и они охватывают большинство, но не все мои точки, давая мне представление о центроиде и разбросе точек в каждой группе. Но я изо всех сил пытаюсь четко сформулировать, что представляют собой эти эллипсы. Означают ли они, что мы уверены на 60%, что истинное среднее значение каждой группы лежит в ее эллипсе? Или мы на 60% уверены, что среднее + 1 стандартное отклонение каждой группы лежит в ее эллипсе? Или что-то совершенно другое? Как изменится эта интерпретация, если я изменю уровень достоверности conf в пределах ordiellipse()? Или эллипс kind от SD до SE?