Всем доброго времени суток
Я действительно изо всех сил пытаюсь получить файл метаданных в Rstudio для анализа. Импорт файла работает отлично, однако, в тот момент, когда я пытаюсь сгенерировать объект phyloseq, я получаю эту ошибку: Ошибка в 1: nrow (SM): аргумент длины 0.
Мой код:
# This is to import the file into Rstudio
metadata_ASV = read.table(file.choose(), header = TRUE, row.names = 1, sep = "\t")
Затем я проверяю форму файла
class(metadata_ASV)
Ниже приведена команда, которую я использую для создания объекта phyloseq. Эта команда работала ранее, но вдруг она больше не работает.
ASV_sampledata = sample_data(metadata_ASV)
Любое понимание причины ошибки:
Ошибка в 1: nrow (SM): аргумент длины 0
Спасибо Заранее вам за любую помощь в этом.
С уважением Sunette