То, что вы не выполняете автоматическую фиксацию, не гарантирует, что нет ручной фиксации.
В любом случае, auto.offset.reset=latest
никогда не отправит группу потребителей в начало топи c. Похоже, что любой инструмент / библиотека Kafka, который вы используете, вызывает consumer.seekToBeginning
вызов самостоятельно.