Проблемы с установкой Rgdal в RStudio на MA C - пробовал анаконду, доморощенный - PullRequest
Новая
       41

Проблемы с установкой Rgdal в RStudio на MA C - пробовал анаконду, доморощенный

0 голосов
/ 26 февраля 2020

У меня много проблем при попытке установить RGDAL на Rstudio (Anaconda) в Ma c.
Сначала я попытался загрузить его в Anaconda, используя - 

conda install -c conda-forge r-rgdal

в терминале.

Это не сработало, так как продолжало зависать и не могло решить проблему окружающей среды. (Это продолжало цикл). Solving environment: failed with initial frozen solve. Retrying with flexible solve.

Затем я попытался установить GDAL в homebrew, который установил необходимые пакеты, используя brew install gdal

Однако теперь, когда я пытаюсь запустить install.packages ("rgdal") в RStudio. Я получаю следующую ошибку: 

configure: R_HOME: /opt/anaconda3/lib/R
configure: CC: x86_64-apple-darwin13.4.0-clang
configure: CXX: x86_64-apple-darwin13.4.0-clang++ -std=gnu++11
configure: C++11 support available
configure: rgdal: 1.4-7
checking for /usr/bin/svnversion... yes
configure: svn revision: 845
checking for gdal-config... /usr/local/bin/gdal-config
checking gdal-config usability... yes
configure: GDAL: 2.4.4
checking C++11 support for GDAL >= 2.3.0... yes
checking GDAL version >= 1.11.4... yes
checking GDAL version <= 2.5 or >= 3.0... yes
checking gdal: linking with --libs only... no
checking gdal: linking with --libs and --dep-libs... no
./configure: line 2010: x86_64-apple-darwin13.4.0-clang++: command not found
./configure: line 2025: x86_64-apple-darwin13.4.0-clang++: command not found
configure: Install failure: compilation and/or linkage problems.
configure: error: GDALAllRegister not found in libgdal.
ERROR: configuration failed for package ‘rgdal’
* removing ‘/opt/anaconda3/lib/R/library/rgdal’
Warning in install.packages :
  installation of package ‘rgdal’ had non-zero exit status

Любая помощь будет принята с благодарностью, Спасибо!

Примечание: я также получил следующее предупреждение после установки gdal на homebrew. 

Warning: gdal dependency gcc was built with a different C++ standard
library (libstdc++ from clang). This may cause problems at runtime.
?  /usr/local/Cellar/gdal/2.4.4: 280 files, 54.6MB

Не уверен, если это связано, хотя

...