Я уверен, что есть способ сделать это - но я еще не слышал об этом, и я довольно хорошо следю за Magento.
К сожалению, Magento не импортирует настраиваемые продукты через серверную часть. Обычно вам нужно написать собственный сценарий с использованием Magento API или импортировать все простые продукты, а затем вручную (или снова с помощью API) создать настраиваемые продукты, назначая им простые продукты.