Может быть, разветвление поможет тебе? Вы можете заключить основную часть обработки в функцию, например, вот так:
topdf() {
local djvu_file=$1
djvu2pdf "$djvu_file"
}
for i in *.djvu; do topdf "$i" & done
Как видите, есть символ "&", который говорит, что операция должна быть отправлена в фоновый режим.