Не уверен, что это ответ, который вы ищете, но после разрешения конфликтов на File2.txt
вам не нужно фиксировать эти изменения. Что вам нужно сделать, это внести изменения и подать сигнал git, чтобы продолжить перебазирование
vim File2.txt // solve your conflicts and save the file
git add File2.txt
git rebase --continue // or --skip, depending on how you solve your conflicts