У меня есть пять фреймов данных s d1-d5 с переменным количеством строк, каждая из которых превышает 3000, но равное количество столбцов (6): VarID, Name, LogFC, LogCPM,Pval and FDR. Около 1000 из VarID являются общими для пяти фреймов данных. Вот так выглядят данные в каждом фрейме данных
VarID Name LogFC LogCPM Pval FDR
-------------------------------------------------------------------
varid1 Name1 logfc1 logcpm1 pval1 fdr1
varid2 Name2 logfc2 logcpm2 pval2 fdr1
- - - - - -
- - - - - -
- - - - - -
varid3000+ Name3000+ logfc3000+ logcpm3000+ pval3000+ fdr3000+
I want to extract all the 1000+ common VarIDs from each dataframe to form extracted dataframes edf1-edf5. Then merge their LogFC values to a common dataframe, cdf in the following format:
ID edf1-logfc edf2-logfc edf3-logfc edf4-logfc edf5-logfc
-----------------------------------------------------------------------------------
commonvarID1 a b c d e
commonvarID2 f g g h a
- - - - - -
- - - - - -
commnonvarID1000+ b d a g f
Я использовал common <- intersect(df1$ID,df2$ID), но это только создает пересечение для df1 и df2, что означает, что я должен использовать это commonvar, чтобы найти второе пересечение между это и df3, потом df4 и df5. В конце концов я не получаю то, что хотел. Будем очень благодарны за любые идеи относительно того, как это сделать в r или python.
Заранее спасибо.