Я опробовал этот пример, и он работал для меня:
<html>
<head>
<title>Test!</title>
<script src="jquery-1.3.2.js"/>
</head>
<body>
<div id="foobar">
<p>
This is <br/> some <br/> text.
</p>
</div>
<input type="button" value="Click" onclick="$('#foobar p').find('br').remove();"/>
</body>
</html>
Есть ли что-то отличное от того, что вы пытаетесь сделать?