У меня проблемы с установкой пакетов R в среде conda на MacOS 10.15.4. Команда install.packages() в R приводит к следующему типу ошибок (я не вставляю полный журнал):
ld: symbol(s) not found for architecture x86_64
clang-4.0: error: linker command failed with exit code 1 (use -v to see invocation)
Error 1
ERROR: compilation failed for package ‘xml2’
checking for gcc... x86_64-apple-darwin13.4.0-clang
checking whether the C compiler works... no
configure: error: in `/private/var/folders/k6/p2cdz1dx32g3p4hmwghns3fc0000gn/T/RtmpdPz2VA/R.INSTALL4817a82715f/uuid':
configure: error: C compiler cannot create executables
Я использую версию r 3.6.1 на платформе x86_64-apple-darwin13.4.0 Версия clang:
версия clang 4.0.1 (теги / RELEASE_401 / final)
Цель: x86_64-apple-darwin19.4.0
Модель потока: posix
Установленный каталог: / opt / anaconda3 / envs / r_omics / bin
Поэтому я предположил, что возникла проблема / конфликт с тем, как компиляторы C на моем компьютере обрабатывают Установка R-пакетов, но я не знаю, как это решить. Каким-то образом мне удается установить некоторые пакеты через conda install, но мне не удается через это восстановить нужную мне среду.
Большое спасибо за вашу помощь