Это известная ошибка в браузерах webkit.
Самый простой способ заставить его работать так, как вам нравится в Chrome, а Safari - вручную указать стиль самого выбора.
select {
height: 54px;
font-size: 14px;
}
<select size="3">
<option value="">Default</option>
<option value="1">op1</option>
<option value="2">op2</option>
<option value="3">op3</option>
</select>