То, что вы делаете, правильно, но вам нужно зафиксировать свои изменения, вызвав IssueManager.updateIssue
import com.atlassian.jira.event.type.EventDispatchOption //add-this-line
import java.util.Date
import java.sql.Timestamp
import com.atlassian.jira.component.ComponentAccessor
import com.atlassian.jira.issue.IssueManager
import com.atlassian.jira.issue.MutableIssue
def customFieldManager = ComponentAccessor.getCustomFieldManager()
IssueManager im=ComponentAccessor.getIssueManager()
MutableIssue issue = im.getIssueObject('ISSUEKEY')
issue.setDueDate(new Timestamp((new Date() + 7).time))
issue.getDueDate()
def currentUser = ComponentAccessor.getJiraAuthenticationContext().getLoggedInUser()//add-this-line
im.updateIssue(currentUser, issue, EventDispatchOption.DO_NOT_DISPATCH , false) //add-this-line
Вы устанавливаете значение проблемы правильно, но не сохраняете свои изменения
IssueManager.updateIssue сохранит все изменения