Нет способа отменить это в git.
Однако, если у вас есть файл, открытый в вашем редакторе, вы можете отменить изменения там. Некоторые редакторы, такие как Emacs, автоматически сохраняют файлы, поэтому попробуйте поискать файлы с одинаковыми именами и расширениями ~ или #.