Эти цвета могут быть настроены и не являются цветами по умолчанию для темной темы. Эту неверную конфигурацию можно было сделать вручную или произошло путем установки или использования стороннего подключаемого модуля.
Чтобы определить, является ли это неверной конфигурацией, перейдите в новое рабочее пространство без копирования настроек.
В этом случае от go до Окно> Параметры: Общие> Внешний вид> Цвета и шрифты редактируйте цвет в Просмотр и редактирование папок или нажмите Восстановить настройки по умолчанию .