В пакете kml реализовано k-средство для продольных данных . Кластеризация работает просто отлично.
Теперь мне интересно, как я могу показать «структуру» кластеров, например, покрасив их.
Самый простой пример из документации ( файл справки для функции clusterLongData ..):
library(kml)
traj <- matrix(c(1,2,3,1,4, 3,6,1,8,10, 1,2,1,3,2, 4,2,5,6,3, 4,3,4,4,4, 7,6,5,5,4),6)
myCld <- clusterLongData(
traj=traj,
idAll=as.character(c(100,102,103,109,115,123)),
time=c(1,2,4,8,15),
varNames="P",
maxNA=3
)
kml(myCld, 2, toPlot = 'both')
Этот пример кода находит два кластера и выводит на экран кластеры, а также базовые данные. Но я не вижу, какие траектории связаны с каким кластером.
- Есть ли возможность внутри Пакет kml для окрашивания траекторий в тот же цвет, что и на кластерах?
- Есть ли другие идеи или опыт для создания графика, показывающего кластеры плюс траекторию ассоциации <> кластер? (например, с ggplot2 на объекте
myCld?)
Заранее благодарим за любые подсказки ..