Вот решение. Это было немного сложно, но я думаю, что это покрывает ваше дело. Это решение может быть проблематичным c, если у вас есть NA в середине ряда, но мне пока не удалось найти лучший способ.
df <- read.table(header=TRUE,
text="
Country Year col3. col4. col5
USA2018 10 50 13 NA
UK2018 4 12 6 NA
China 2018 15 4 1
Malta NA 2018 25 8")
tmpN <- names(df) # save the colnames
df = cbind(df[,1],df) # duplicate the first column
df[,c(1,2)] <- lapply(df[,c(1,2)], as.character)
df[,1] = sub('[[:digit:]]+','',df[,1]) # remove date in first column
df[,2] = sub('[[:alpha:]]+','',df[,2]) # remove city in second column
df[df==''] <- NA # replace empty cells with NA
# push all NA to the right side
df2 = as.data.frame(t(apply(df,1, function(x) { return(c(x[!is.na(x)],x[is.na(x)]) )} )))
df2 <- df2[,!(colSums(is.na(df2))==nrow(df2))] # remove column full of NA
colnames(df2) <- tmpN # replace colnames