SSL / TLS сертификаты являются средством аутентификации. Центр сертификации, в котором вы регистрируете свой сертификат (например, LetsEncrypt), подтвердит, что вы действительно являетесь владельцем домена, для которого вы пытаетесь зарегистрировать сертификат. Эти сертификаты затем используются для bootstrap шифрованного соединения TLS между пользователями вашего сервера и вашего сервера. Последующая передача данных затем шифруется (я полагаю, это то, что вы имели в виду под «защищенным»?).
Я не уверен, что вы подразумеваете под «защитой» вашей сети или порта. Не могли бы вы уточнить это?