При загрузке страницы меню скрыть родительское меню и отобразить только подменю с флажками.
Я пробовал это, но оно не скрывает родительское меню
$('li').on('click', function(e) {
$(this).children('ul').toggle();
$(this).siblings('li').find('ul').hide();
e.stopPropagation();
});