Если вы уже знаете, как сделать это с pyplot, вы можете сохранить его в файл и обрабатывать его статически, js не требуется.
Чтобы вывести ваш график в файл:
plt.savefig('clusters.png')
Затем используйте тег HTML img:
<!DOCTYPE html>
<html>
<head>
<title>Display my Matplotlib Image</title>
</head>
<body>
<img src="clusters.png" alt="Large and small circles representing clusters">
</body>
</html>
Чтобы увидеть результат, просто откройте указанный выше файл html в своем браузере.