Я никогда не работал с 3D, но быстрый поиск показал, что можно использовать файлы STL в JavaScript, и, так как это веб-приложение, которое вы все равно захотите использовать, вы можете использовать HTML5 Ввод файла, чтобы спросить пользователь, чтобы предоставить файл, здесь это ссылка. Кстати, он использует три. js - библиотеку, с которой я тоже не знаком, но в посте, на который я ссылаюсь, есть пример того, как его использовать.